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Résumé du colloque
Il est largement admis que les mitochondries sont le produit d'une symbiose entre une bactérie à Gram négatif et une autre cellule, conduisant à la création de la ligne de cellules eucaryotes. Ainsi les protéomes bactériens peuvent être considérés comme un point de départ possible pour tenter de comprendre le protéome mitochondrial. De la même façon que les mitochondries, les bactéries à Gram négatif sont entourés de deux membranes. La membrane externe des protéomes bactériens sont presque exclusivement composées de protéines membranaires bêta-baril (BOMP). Plus de 100 familles de BOMPs existent chez les bactéries, où ils fonctionnent généralement comme des transporteurs. Bien que certaines estimations préliminaires suggèrent que les mitochondries auraient un nombre similaire de familles, seulement 5 de ces familles de beta-barrel protéines de membrane externe (MBOMP) ont été identifiés à ce jour chez les mitochondries. Nous tentons de combler cette lacune par une analyse informatique qu considère la similarité de séquence, l'intégration des signaux membranaires putatifs (bêta-signaux), et la prédiction de structures secondaires. Notre conclusion est qu'il y a peu ou pas de MBOMPs encore à découvrir. Une ramification de ce résultat est que, pour plusieurs molécules, l'interface entre les mitochondries et le reste de la cellule est définie par un très petit nombre de protéines.
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