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Évolution d'un cadre de lecture ouvert chloroplastique dans la phylogénie des plantes

Martine Richard
Rodolphe Boivin
Guy Bellemare
MR

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Martine Richard

Résumé du colloque

Nous avons caractérisé un cadre de lecture ouvert dans le génome chloroplastique de l'algue Chlamydomonas reinhousii. Ce cadre de lecture de 1097 563 acides aminés (ORF563) et il est homologue à 79% en acides nucléiques et 89% en acides aminés avec l'ORF513 du génome chloroplastique de l'hépatique Marchantia polymorpha. En utilisant la séquence de l'ORF 563 comme sonde, nous avons retrouvé des fragments homologues dans le DNA génomique de plantes non vasculaires (mousses, hépatiques), de plantes vasculaires primitives (prêles, fougères), et de gymnospermes (conifères et Ginkgo biloba): ce fragment se retrouve donc dans toutes les étapes évolutives jusqu'aux gymnospermes, et chez G. biloba il a en outre été localisé dans le génome chloroplastique. Par contre chez les angiospermes testées le gène semble être disparu du génome chloroplastique; cependant on ignore le point de la phylogénie des angiospermes où cet événement se sera produit, ou s'il aurait dans ce cas été relocalisé vers le génome nucléaire. A l'aide de l'ORF de C. reinhousii nous avons isolé dans le DNA chloroplastique le gène du ginkgo. Les premiers résultats de séquence nous montrent un haut degré d'homologie avec l'ORF513 de M. polymorpha, et une homologie moindre avec l'ORF563 de C. reinhousii.

Contexte

Section :
Biologie moléculaire
news icon Thème du colloque :
Biologie moléculaire
host icon Hôte : Université de Montréal

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Titre du colloque :

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