Colloque

Examen de l'interaction de différents domaines du RNA 16S avec la sous-unité ribosomique 50S

François Dragon

Paul Romaniuk

Lea Brakier-Gingras

Membre a labase

François Dragon

Résumé du colloque

Le RNA 16S de la sous-unité 30S du ribosome bactérien est divisé en 4 domaines principaux. À partir d'un plasmide contenant le gène du RNA 16S d'E. coli sous contrôle d'un promoteur T7, nous avons construit des plasmides permettant la transcription in vitro des domaines 1 et 2, le domaine 3 et les domaines 3 et 4 du RNA 16S. Ces domaines isolés doivent globalement conserver leur structure native. Le RNA 16S peut interagir avec la sous-unité 50S in vivo. Les domaines "mini-sous-unités" 30S, isolés à partir de mutants de protéines absentes de la sous-unité 30S (S4, S6, S8, S15, S18 et S20 pour le domaine 1 et 2, S8, S15, S18 et S19 pour le domaine 3 ou les domaines 3 et 4), formant des "mini-sous-unités" 30S qui peuvent être purifiées par centrifugation au travers d'un gradient de sucrose et peuvent ainsi s'associer aux sous-unités 50S. La comparaison des capacités de liaison des différents domaines du RNA 16S à la sous-unité 50S, en l'absence ou en présence de protéines ribosomiques 30S, permet de préciser l'affinité des différents domaines du RNA 16S pour la sous-unité 50S et de déterminer le rôle des interactions RNA-protéines à cette association.

Contexte

Section :

Biologie moléculaire

Thème du colloque :

Biologie moléculaire

Hôte : Université Laval

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Titre du colloque :

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