Colloque

Fréquence des événements de conversion génique dans le génome humain

Guy Drouin

Membre a labase

Guy Drouin

Résumé du colloque

Quoique plusieurs exemples de conversion génique entre les membres des familles multigéniques du génome humain aient été publiés, la fréquence de ces événements n'a jamais été étudiée. J'ai entrepris une telle étude et j'en présente les résultats préliminaires. Mon approche consiste en cinq étapes. J'utilise la banque de donnée Hovergen pour extraire les alignements des séquences protéiques de toutes les familles multigénique humaine contenant plus de trois gènes. J'utilise ensuite le logiciel Query, distribué avec la banque de donnée Hovergen, pour extraire les séquences d'ADN codant pour ces protéines. J'aligne ensuite ces séquences d'ADN en me basant sur l'alignement des protéines. La quatrième étape consiste à analyser ces séquences pour déterminer s'il y a eu un ou des événements de conversion géniques entre les membres de chaque famille multigénique. Cette analyse est faite à l'aide d'un logiciel qui applique la méthode de Sawyer. Quoique cette méthode soit spécifique aux régions codantes des gènes, elle fut choisie parce qu'elle ne requiert pas que les relations évolutives des gènes analysés soient connues. Finalement, la méthode de Grassly et Holmes est utilisée pour identifier les régions impliquées dans des événements de conversion génique. Ces analyses permettront d'estimer la fréquence des événements de conversion génique dans le génome humain.

Contexte

Section :

Biologie et génétique moléculaires

Thème du colloque :

Biologie et génétique moléculaires

Responsables :

Rémy Aubin

Hôte : Université d’Ottawa

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