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Génératif et analyse des populations conformationnelles de molécules peptidiques

André Michel
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André Michel

Résumé du colloque

Notre laboratoire a développé récemment une méthode d'analyse conformationnelle particulièrement adaptée aux molécules peptidiques. La grande flexibilité de ces structures rend très complexe voire impossible l'exploration complète de leur espace conformationnel. Aussi, avons-nous cherché à développer une approche théorique permettant de générer un échantillon représentatif de l'ensemble des conformères possibles. La méthode est basée sur les calculs d'énergie conformationnelle et des techniques de minimisation de ces énergies dans un champ de force à géométrie restreinte, seuls les angles de torsion sont autorisés à varier. Des conformations aléatoires sont générées et les énergies correspondantes minimisées afin de rejoindre une conformation stable, correspondant au minimum local d'énergie le plus proche. Des applications de la méthode seront présentées dans le cadre de peptidomimétique. Nous montrons également une application dans le domaine des peptides susceptibles de complexer les ions calcium.

Contexte

Section :
Structure tridimensionnelle, une approche moléculaire moderne
news icon Thème du colloque :
Structure tridimensionnelle, une approche moléculaire moderne
host icon Hôte : Université de Sherbrooke

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Titre du colloque :

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