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Hybridation génomique comparative de lignées de médulloblastomes

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Sophie Dubé

Résumé de la communication

Le médulloblastome (MB), tumeur ectodermique du cervelet, représente environ 20 % des cancers pédiatriques du système nerveux central. L'évolution clinique de cette tumeur est variable et est reliée aux moyens thérapeutiques qui sont considérés comme insuffisants surtout à cause de la caractérisation incomplète de ce cancer. Dans le MB, la perte récurrente d'une portion des bras courts du chromosome 17 suggère la présence de séquences qui joueraient un rôle important dans le développement de cette tumeur. En ce qui concerne les lignées cellulaires de MBs, présentées dans la littérature, aucune analyse chromosomique détaillée n'a été effectuée. Ainsi, la caractérisation de plusieurs remaniements chromosomiques demeure encore imprécise. Il est donc impératif de développer des modèles bien caractérisés nous aidant à mieux comprendre la pathogenèse de ce cancer, ainsi que de nouvelles stratégies améliorant le diagnostic, le pronostic et la thérapeutique. Par conséquent, l'objet de ce projet est d'effectuer une caractérisation cytogénétique complète, à la fois par le caryotype et l'hybridation génomique comparative (CGH), de nouvelles lignées de MBs établies par un groupe de recherche de l'hôpital Ste-Justine. Grâce au CGH, nous avons détecté des segments amplifiés ou perdus sur plusieurs chromosomes, dont le chromosome 17, de la première lignée UM-MB1 que nous avons étudiée. Le principe de cette technique consiste à co-hybrider les ADNs normaux et tumoraux, en présence d'ADN Cot-1, en marquant par nick-translation l'ADN tumoral avec la biotine-14-dCTP et l'ADN normal avec la digoxigenine-11-dUTP et en révélant les deux sondes avec des fluorocromes différents (vert et rouge). En utilisant un système d'image et un microscope à épifluorescence, nous pouvons mettre en évidence les séquences d'ADNs perdues ou amplifiées dans l'ADN tumoral par un calcul des ratios de fluorescence. La technique permet de détecter rapidement les changements de nombre de copies des séquences d'ADNs (perte, délétion, duplication, amplification) dans un génome. Elle augmente considérablement la sensibilité de détection des anomalies chromosomiques dans les cellules tumorales. Par conséquent, la mise en évidence de ces segments facilitera l'identification ultérieure de gènes potentiellement impliqués dans le MB et permettra d'acquérir plus d'information sur les mécanismes de développement et de progression de ce cancer.

Contexte

news icon Domaine de la communication :
Biochimie, biologies cellulaire et moléculaire
host icon Hôte : Université de Montréal

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