Colloque

Interaction de la protéine ribosomale S1 et du facteur d'initiation IF3 avec le domaine 3' majeur et le site de décodage de la sous-unité 30S d'E. coli

Michael Laugiera

John Tam

Membre a labase

Michael Laugiera

Résumé du colloque

La protéine S1 et le facteur d'initiation IF3 jouent un rôle essentiel dans le processus d'initiation de la synthèse des protéines chez E. coli. S1 et IF3 manifestent de la coopérativité lors de l'initiation de la synthèse protéique. Pour mieux comprendre leur rôle lors de l'initiation, nous avons utilisé des sondes chimiques (tels diméthyl sulfate, kethoxal, etc...) et enzymatiques (tels RNase V1, nucléase S1) pour évaluer l'impact de l'absence de S1 ou de IF3 sur la réactivité et l'accessibilité d'environ 700 nucléotides de la sous-unité 30S. Les sites de réaction ou de coupures sont identifiés par transcription réverse de l'ARN 16S. Nous trouvons que S1 interagit avec l'hélice 40 de l'ARN 16S, au milieu du domaine 3' majeur de ce ARN, et que IF3 empêche RNase V1 de couper le lien phosphodiester séparant C1407 de A1408, dans le site de décodage du ribosome. Ces résultats permettent de raffiner nos idées sur la position de l'hélice 40 dans la sous-unité 30S et suggèrent un rôle important pour IF3, à la frontière entre le site P et le site A. Entre autres, on peut maintenant formuler une hypothèse impliquant IF3 pour expliquer comment l'antibiotique néomycine inhibe l'initiation de la synthèse des protéines.

Contexte

Section :

Biologie moléculaire

Thème du colloque :

Biologie moléculaire

Hôte : Université de Sherbrooke

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Titre du colloque :

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