Colloque

Interactions Lipide-Protéine: Etude de Dynamique Moléculaire de la Gramicidine A dans une Bicouche de DMPC

B. Roux

T.B. Woolf

Membre a labase

B. Roux

Résumé du colloque

Des simulations de dynamique moléculaire de la gramicidine A (GA) dans une bicouche de phospholipides DMPC sont décrites. Un modèle atomique détaillé est utilisé afin de représenter les interactions microscopiques. Les simulations sont faites dans le but d'explorer les propriétés de l'enchaînement GA:DMPC faisant l'objet de nombreux travaux de recherche dans les laboratoires de B. Cornell, T. Cross, et J. Davis par des méthodes de résonance magnétique nucléaire de l'état solide. Les déplacements chimiques, les écarts quadripolaires ainsi que les couplages dipolaires sont calculés à partir de la dynamique et comparés aux valeurs expérimentales. Le profil de densité moyen est calculé pour tous les atomes du système. Ces simulations permettent également d'analyser les facteurs microscopiques impliqués au niveau des interactions lipide-protéine. Par exemple, dans ces systèmes, des ponts hydrogènes transitoires sont formés par les N-H des chaînes latérales des tryptophanes avec les esters carbonyles des acides gras.

Contexte

Section :

Complexes lipide-protéine : organisation et fonctions

Thème du colloque :

Complexes lipide-protéine : organisation et fonctions

Hôte : Université du Québec à Montréal

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