Colloque

La corrélation entre la longueur des gènes et la fréquence de nucléotides

Donal Hickey

Hamid Nikbakht, Mihai Albu

Membre a labase

Donal Hickey

Résumé du colloque

La fréquence des nucléotides varie beaucoup entre divers génomes. Cette fréquence peut varier aussi à l’intérieur d’un seul génome. Par exemple, dans le génome de Oryza sativa certaines des séquences codantes ont une fréquence très élevée en G+C et d’autres genes dans le même génome ont une fréquence de G+C qui est près de 50 %. Nous avons découvert qu’il existe une corrélation négative entre la longueur des séquences codantes et le biais vers G+C. Dans le génome de Apis mellifera, par contre, le biais est vers A+T plutôt que vers G+C. Dans ce dernier cas, nous avons trouvé une corrélation positive entre la longueur des genes et la fréquence de G+C, ce qui parait le contraire de ce qu’on observe dans le génome de Oryza sativa. Mais les deux génomes se ressemblent en tant qu’il existe une corrélation négative entre la longueur des genes et la quantité de biais. Nous proposons une explication pour cette corrélation, basée sur une interaction entre sélection et recombinaison.