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Résumé du colloque
Les topoisomérases ADN sont reconnues depuis longtemps comme étant des facteurs clés pour la régulation du superenroulement de l'ADN chez E. coli. Deux enzymes antagonistes ont pour rôle d'introduire du superenroulement négatif ou de le relaxer, ce sont respectivement la gyrase (topoisomérase II) et la topoisomérase I. Ces enzymes seront surtout actives durant la transcription, un processus qui génère du superenroulement négatif en amont de la polymérase et du superenroulement positif en aval. Ainsi la conformation de l'ADN est le résultat de l'équilibre dynamique qui s'opère surtout durant la transcription et auquel participe les toposomérases. Cet équilibre sera très affecté advenant une modification dans l'activité des topoisomérases. Les effets toucheront toutes les fonctions majeures de l'ADN, soit la réplication, la transcription et la recombinaison. Nous avons récemment démontré qu'un des rôles majeurs de la topoisomérase I est de prévenir la formation des hybrides ARN-ADN (R-loops) durant la transcription, alors que la gyrase favorise leur formation. Il est donc possible que la structure R-loop soit le dénominateur commun expliquant plusieurs effets des topoisomérases sur les fonctions de l'ADN. Nous avons isolé des séquences d'ADN provenant des opérons rrn, codant pour les rRNA, qui lorsque transcrites, ont tendance à former des R-loops. L'étude de telles séquences nous permettra d'étudier les paramètres importants pour la formation de R-loops, ainsi que les conséquences de telles structures sur les activités génomiques.
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