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Le génome mitochondrial du champignon inférieur Allomyces macrogynus

Bruno Paquin
Franz B. Lang
BP

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Bruno Paquin

Résumé du colloque

Allomyces macrogynus (A.m.) est un champignon filamenteux qui, dans la taxonomie classique, est considéré comme un "vrai champignon inférieur". Afin d'approfondir nos connaissances sur le genre Allomyces, nous avons décidé de séquencer le génome mitochondrial de A.m. Une analyse détaillée des séquences déterminées (95% des 56 kb) révèle la présence de tous les gènes mitochondriaux usuels, encodés selon le même brin, et l'utilisation du code de traduction universel. La position phylogénétique, telle qu'obtenue via la comparaison des gènes codant pour l'ARN ribosomique confirme le caractère inférieur de A.m. Nous avons aussi observé la présence d'un cadre de lecture non identifié qui code pour une protéine probable de 14 acides aminés (ORF 414). Celui-ci se retrouve entre deux séquences fortement similaires codant pour la partie C-terminal d'un gène de structure (atp6). La comparaison de cette région du génome avec la région correspondante du génome mitochondriale de A. arbuscula, suggère que l'ORF 414 ainsi que la partie C-terminal du gène actif de l'atp6 chez A.m., proviennent d'une autre espèce via un transfert horizontal. Enfin, dans la plupart des régions intergéniques, nous retrouvons des séquences riches en GC pouvant être repliées pour former des doubles structures en épingle à cheveux. Deux cadres de lecture introniques voient aussi leurs séquences interrompues par ce genre de structures. Le rôle possible de ces dernières sera discuté.

Contexte

Section :
Biologie moléculaire
news icon Thème du colloque :
Biologie moléculaire
host icon Hôte : Université de Montréal

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Titre du colloque :

Biologie moléculaire
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Thème du colloque :

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