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Logiciel d'analyse et de gestion de patrons électrophorétiques de plasmides bactériens

Jérard Ozanne
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Jérard Ozanne

Résumé du colloque

La détermination du poids moléculaire (PM) d'un plasmide suite à une électrophorèse sur gel d'agarose peut se faire graphiquement (courbe standard) ou mathématiquement (équation de la droite standard obtenue par la méthode des moindres carrés), cette dernière étant plus précise. Un logiciel (IMB-PC, MS-DOS 2.0, BASIC) de traitement mathématique et de stockage de patrons électrophorétiques (PM) de plasmides a été développé lors d'une étude épidémiologique de la transmission de certains plasmides à l'intérieur de populations données. Ce logiciel permet: 1. d'entrer toutes les informations pertinentes quant à un gel d'agarose (date, expérience, standard, souches, distances de migration, etc.); 2. de déterminer l'équation de la courbe standard et de calculer le PM des plasmides mis en évidence; 3. d'obtenir une reproduction graphique du gel (moniteur et/ou imprimante ou traceur); 4. de gérer (fichiers sur disquettes) toutes ces informations pour référence future. Ce logiciel, auto-documenté, est utile en épidémiologie car il permet de comparer facilement et rapidement les populations plasmidiques portées par des souches bactériennes isolées de diverses sources.

Contexte

Section :
Microbiologie, virologie et immunologie
news icon Thème du colloque :
Microbiologie, virologie et immunologie
host icon Hôte : Université du Québec à Chicoutimi

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Titre du colloque :

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