Colloque

Modèles de mutation-sélection pour l’étude de l’évolution de gènes codants

Nicolas Rodrigue

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Nicolas Rodrigue

Résumé du colloque

En utilisant des approches non-paramétriques et empiriques, nous proposons des modèles d'évolution de codons pouvant capter l'hétérogénéité du caractère adaptatif des acides aminés en différentes positions de la protéine produite par un gène particulier. Ces modèles sont inspirés de résultats théoriques obtenus en génétique des populations, où un facteur de mutation et un de sélection sont combinés pour spécifier le processus de substitution final. Nous avons implémenté ces modèles dans un contexte Bayesien, exploitant les méthodologies d’échantillonnage par chaînes de Markov Monte Carlo. A partir de données réelles, nous démontrons que le pouvoir prédictif de ces modèles dépasse celui des modèles existants, et ainsi permet une meilleure caractérisation des pressions sélectives.