Colloque

Modèles de substitutions issues du principe d’équilibre mutation-sélection

Nicolas Rodrigue

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Nicolas Rodrigue

Résumé du colloque

Nous proposons des modèles d’évolution au niveau codon pouvant capter l’hétérogénéité du caractère adaptatif des acides aminés en différentes positions d’une protéine produite par un gène donné. Ces modèles, inspirés de résultats théoriques de la génétique des populations, combinent un facteur mutationnel (globale) et un facteur de sélection (hétérogène le long d’un alignement), spécifiant ainsi le processus de substitution final. A partir d’exemples de données interspécifiques réelles (et des arbres phylogénétiques associés), nous démontrons que les modèles mènent à des inférences raisonnables du processus mutationnel, des contraintes site-spécifiques au niveau acides aminés, et de distributions de coefficients de sélection. Nos modèles peuvent servir de point de pivot autour duquel pourrait s’articuler plusieurs variations, par exemple, pour tenir compte d’effets sélectifs supplémentaires, ou de changements de tailles des populations le long de la phylogénie.