Colloque

Modèles mécanistiques d'évolution moléculaire et reconstruction phylogénétique des variations de traits d'histoire de vie

Nicolas Lartillot

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Nicolas Lartillot

Résumé du colloque

L’objet des modèles mécanistiques d’évolution moléculaire est de dériver le processus de substitution opérant sur la longue durée évolutive à partir des mécanismes élémentaires de la génétique des populations. De tels modèles articulent les effets combinés de la pression mutationnelle, la sélection et la dérive génétique. Ils permettent ainsi de faire une connection entre le processus de substitution et les conditions écologiques (en particulier tailles de populations), cellulaires (constitution karyotypique) physiologiques (e.g. métabolisme, temperature) ainsi que d’autres traits d’histoire de vie (longévité, temps de génération), tous susceptibles de varier, parfois sur plusieurs ordres de grandeur, entre espèces proches. Une methode générale pour construire des modèles Bayésiens décrivant les couplages mentionnés ci-dessus entre processus d’évolution moléculaire et traits de vie, ainsi que leurs variations corrélées le long des lignages, sera présentée. Cette méthode s’appuie sur une généralisation multivariée des processus autocorrélés utilisés classiquement dans les modèles de relaxation d’horloge moléculaire. Son application a des données à différentes échelles évolutives (mammifères, animaux, eubactéries) sera effectuée, illustrant comment la méthode peut être utilisé pour démêler les contributions respectives des différents traits d’histoire de