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Modélisation de la synapse chimique à l’aide de réseaux de Pétri

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Simon Hardy

Résumé de la communication

De nouvelles approches de modélisation des systèmes de biologie moléculaire sont actuellement développées dans le but d’avoir une meilleure compréhension des processus biologiques et des fonctions cellulaires. Des résultats récents ont identifié les modèles basés sur les réseaux de Pétri comme ayant une haute affinité pour la modélisation des systèmes biologiques. Les réseaux de Pétri sont un outil informatique de modélisation graphique et mathématique pour la description et l’étude de systèmes caractérisés par des propriétés de concurrence, d’asynchronisme et d’indéterminisme. Plusieurs types de processus biologiques, comme le métabolisme, les réseaux de régulation et la signalisation cellulaire, ont été modélisés à l’aide des variantes colorées, stochastiques et hybrides des réseaux de Pétri, que ce soit pour faire une analyse structurale ou une analyse quantitative. Nous ferons une présentation de cette approche de modélisation et de l’application aux neurones que nous en avons faite, plus précisément aux activités biologiques se déroulant dans la fente synaptique lors d’une synapse chimique : exocytose et dégradation enzymatique des neurotransmetteurs, liaison du récepteur et du neurotransmetteur et ouverture des canaux ioniques de la cellule post-synaptique. Avec l’ajout de certains paramètres, le modèle devrait permettre une simulation quantitative du système.

Contexte

news icon Domaine de la communication :
Informatique et génie logiciel
host icon Hôte : Université du Québec à Montréal

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Thème du communication :

Informatique et génie logiciel

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