pen icon Colloque
quote

Modélisation de l'oxydation des bases indoliques

Pierre J.-L. Plourde
Marcel Delaforge
Narendra K. Srivastava
Noyan Turkirkan
Christophe K. Jankowski
François Soler
PJ

Membre a labase

Pierre J.-L. Plourde

Résumé du colloque

La modélisation moléculaire est tentée pour compléter l'étude de l'oxydation des bases indoliques par les systèmes biologiques (p. ex. MMO, Cyt P450) ou biomimétiques (Gif, Orsay, pivaloates, Fenton, oxydations radicalaires). L'oxydation avec Cyt P450, pratiquée sur le substrat modèle – la carbole mène à l'obtention des dérniers hydroxylés (+O), des cétones-époxydes (-2H, +O), une double hydroxylation et la réduction (+2H). Les produits hydroxylés ont été obtenus en tant que produits majeurs et les positions de l'hydroxylation ont été déterminées. Afin d'expliquer ces résultats, trois études ont été entreprises: modélisation sur le site hème; établissement des canaux de passage des bases indoliques à travers un corps de Cyt P450, passage par les canaux. Le tachéage des tranches parallèles au plan de l'hème et celles des tranches coupées vers l'atome de Fe de l'hème à partir de la surface externe du Cyt P450 ont été utilisées. Nous avons établi des nombres de canaux menant vers l'hème (trois et courbés) et des contraintes, et lancé l'hypothèse expliquant les résultats de l'hydroxylation. Les coordonnées des C, extraits pas à pas, ont été utilisées pour les calculs. Nous proposons une méthodologie pour appliquer la modélisation à la recherche des canaux d'autres structures peptidiques (modélisées).

Contexte

Section :
Biochimie, biologie moléculaire
news icon Thème du colloque :
Biochimie, biologie moléculaire
host icon Hôte : Université du Québec à Chicoutimi

Découvrez d'autres communications scientifiques

news icon

Titre du colloque :

Biochimie, biologie moléculaire
Rôle de la glutathion peroxydase intramitochondriale dans la susceptibilité de l’ADN mitochondrial …
Jean Legault
Production et évaluation de l'activité biologique de l'acide oxo-5-éicosatétraénoïque (5-KETO)
Jean-Pierre Falgueryet
L’activité du promoteur du gène encodant la poly(ADP-ribose) polymérase est dépendante du facteur S…
Marie-Josée Bergeron
Voir tous les contenus de ce colloque

Autres communications du même congressiste :

news icon

Thème du colloque :

Biochimie, biologie moléculaire
Modélisation de l'oxydation des bases indoliques
Pierre J.-L. Plourde
Oxydations des alcaloïdes indoliques avec Cp450
Christophe K. Jankowski
Modélisation de l'oxydation des bases indoliques
Pierre J.-L. Plourde