Colloque

Organisation de l'ADN génomique dans les cellules d'eucaryotes

Ronald Hancock

Sergei Razin

Membre a labase

Ronald Hancock

Résumé du colloque

L'ADN génomique des cellules d'eucaryotes est attaché à une structure appelée la matrice nucléaire sous forme d'une série de boucles d'environ 100 kilobases (kb). Certaines données suggèrent que ces boucles sont des unités fonctionnelles de réplication, de transcription, et de recombinaison de l'ADN. Nous avons mis au point des nouvelles méthodes qui permettent l'étude de ces boucles et de leur importance fonctionnelle. L'ADN est clivé in vivo dans les régions d'attachement à la matrice nucléaire par l'intermédiaire de la topoisomérase II, un enzyme localisé à ces régions. La longueur des fragments d'ADN ainsi découpés est de 30-300 kb, et leur séparation par électrophorèse démontre que différents gènes se trouvent dans des fragments dont la longueur est caractéristique du gène. Pour les gènes dont les régions d'attachement ont été identifiées par d'autres méthodes, les sites de clivage correspondent à ces régions. Nous avons cartographié par cette approche l'organisation des gènes qui codent pour l'ARN ribosomique, qui forment des boucles de 35 kb (une unité du gène répété), de l'oncogène c-myc, et d'une région de 1.5 mégabases (Mb) autour du gène humain de l'hypoxanthine phosphoribosyl-transférase. Nous étudions actuellement le gène géant (4 Mb) codant pour la dystrophine humaine, afin de localiser les sites de délétion et de remaniement par rapport aux régions d'attachement de boucles. Les résultats de ces études permettent de mieux comprendre les implications fonctionnelles de cette forme d'organisation de l'ADN génomique, ainsi que son rôle dans l'expression et le remaniement de gènes.