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Phylogénie partielle des Casuarinacées et Hamamélidacées supérieures estimée par l'analyse de séquences complètes du gène rbcL

Laurent Maggia
Martin Michaud
Jean Bousquet
LM

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Laurent Maggia

Résumé du colloque

Le gène chloroplastique codant pour la grosse sous-unité de l'enzyme ribulose 1,5-diphosphate carboxylase (rbcL) a déjà été utilisé avec succès chez les plantes afin d'estimer les relations phylogénétiques. Nous avons déterminé la séquence complète de ce gène de 1437 pb pour des sujets représentatifs des genres actinorhiziens Allocasuarina, Alnus, Casuarina, Gymnostoma et Myrica, ainsi que d'un certain nombre de genres non actinorhiziens voisins (Fagus, Liquidambar, Betula) tous membres de la sous-classe Hamamelidae des Hamamelidae. L'ADN fut amplifié par réaction de polymérase en chaîne et le produit d'amplification asymétrique directement séquencé. Les taux de substitution synonyme et non synonyme furent estimés pour ces gènes à l'aide de méthodes statistiques. Nous avons comparé les homogénéités de taux de substitution. En parallèle, des méthodes de parcimonie furent aussi utilisées, directement à partir des séquences alignées. Les régions statistiquement diagnostiques obtenues ont été vérifiées par l'échange de réchantillonnage des sites. Chez les Casuarinaceae, les arbres phylogénétiques obtenus s'accordent avec les classifications traditionnelles basées sur la morphologie et les datations fossiles. En outre, la diversification des familles supérieures d'Hamamélidacée se serait effectuée rapidement. Cette rapidité se traduit par une plus grande instabilité au niveau des branchements. Parmi les genres testés, l'actinorhizie apparaît probablement comme un dérontige monophylétique.

Contexte

Section :
Biologie moléculaire
news icon Thème du colloque :
Biologie moléculaire
host icon Hôte : Université de Montréal

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Titre du colloque :

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