Colloque

Pourquoi et pour qui un cours de modélisation moléculaire ?

Hermann Dugas

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Hermann Dugas

Résumé du colloque

Depuis quelques années nous avons développé, à l'Université de Montréal, un nouveau cours gradué de modélisation moléculaire. Le but et les objectifs de ce cours, ainsi que les logiciels utilisés, seront présentés dans cet exposé. Le cours se divise en deux grandes section; une partie théorique couvrant les banques de données et les méthodes de minimisation, et une partie pratique sur ordinateur. L'emphase est surtout axé sur les méthodes empiriques de calcul d'énergie en mécanique et en dynamique moléculaire. Dans la partie pratique du cours, l'étudiant se familiarise avec les logiciels comme CHIRON, REACCS, SPARTAN et MACROMODEL. La plupart des exemples sont tirés d'articles récents de chimie médicinale et de design de drogues et l'étudiant doit, dans les quatre dernières semaines du cours, développer un projet individuel sur des stations Silicon Graphics, en utilisant Macromodel comme outil de travail. Un cahier de notes de cours est disponible (environ 500 pages) couvrant aussi les aspects de modélisation de peptides, de RMN et de Rayons-X de macromolécules. En plus, une série de vidéos et de diapositives sont utilisés tout au long du cours comme complément didactique.

Contexte

Section :

Modélisation pour la structure des macromolécules

Thème du colloque :

Modélisation pour la structure des macromolécules

Responsables :

Robert H. Marchessault

Hôte : Université McGill

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