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Prédiction à l'aide de l'ordinateur des structures linéaires du t-ARN

J. Mercier
F. Söler
K. Jankowski
JM

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J. Mercier

Résumé du colloque

Nous présentons un algorithme, pour l'ordinateur, pour la recherche des structures linéaires du t-ARN. Il est connu qu'une des difficultés des premiers travaux pour la prédiction par ordinateur des structures de l'ARN a été le temps CPU augmenté avec le cube du nombre de bases. D'où le besoin d'un algorithme qui évite cette difficulté et qui permet la prédiction des structures secondaires d'un brin d'ARN. Dans une première étape on analyse les structures linéaires de type non-trèfle (clover leaf) qui correspondent à des structures stables obtenues dans un milieu neutre. On étudie en particulier les structures des ala- et phe-t-ARN. Les critères utilisés dérivent du nombre de ponts H et boucles présentes dans la structure, et correspondent à des énergies globales minimales.

Contexte

Section :
Biochimie
news icon Thème du colloque :
Biochimie
host icon Hôte : Université de Moncton

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Titre du colloque :

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