Colloque

Processus de reduction de génome dans un tétraploïde

David Sankoff

Membre a labase

David Sankoff

Résumé du colloque

Nous avançons deux hypothèses nulles au sujet des gènes dupliqués perdus conséquent à la re-diploïdisation d'un génome tetraploïde. L'une est que la paire de gènes destinée à perdre un membre est choisie au hasard, indépendamment du statut des gènes avoisinants, c'est-à-dire si eux-mêmes sont des membres de paires intactes ou réduites. La deuxième hypothèse est que si une paire de gènes dupliqués perd un membre, ce membre est choisi au hasard, c.-à-d. chacun avec probabilité 1/2, indépendamment du statut des gènes avoisinants. À partir des données génomiques sur des levures, plantes et protistes qui ont subi la tétraploïdisation ancestrale, nous ne pouvons pas rejeter la première hypothèse, mais le deuxième ne tient pas. Nous montrons qui les gènes qui survivent la réduction se retrouvent plus souvent à coté l'un de l'autre, sur la même chromosome. Nous discutons de si ce résultat démontre une effet de sélection ou simplement une propriété mécanique du processus de perte de gènes.

Contexte

Section :

Bioinformatique, génomique, épigénétique

Thème du colloque :

Bioinformatique, génomique, épigénétique

Responsables :

Marcel Turcotte David Sankoff

Hôte : Université d’Ottawa

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