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Purification et caractérisation structurale de la pédiocine, une bactériocine produite par Pediococcus acidilactici PAC 1.0

Hélène Gaussier
Muriel Subirade
HG

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Hélène Gaussier

Résumé de la communication

La pédiocine PA-1 est une bactériocine de classe II, produite par Pediococcus acidilactici PAC 1.0, possédant une séquence consensus à son extrémité N-terminale (YGNGV). Son action inhibitrice est dirigée contre plusieurs pathogènes alimentaires dont, notamment, les membres du genre Listeria, Clostridium et Leuconostoc. Elle possède une masse moléculaire de 4 629 Da et est constituée de 44 acides aminés dont 13 polaires, 23 hydrophobes et 8 chargés (HENDERSON et al., 1992). C’est un peptide basique (p.I.9,6, JACK et al., 1995) et hydrophobe. Cependant nous avons montré qu’elle présente un comportement ambivalent en fonction du pH et de l’hydrophobicité du milieu lors de sa purification. Deux ponts disulfure (9-14 et 24-44) stabilisent sa structure secondaire, le second étant indispensable à son activité (Chinkindas et al., 1993). La connaissance de la structure de ce peptide est donc très importante pour comprendre son mécanisme d’action. Celui-ci n’est pas encore connu au niveau moléculaire, mais il a été mis en évidence que la pédiocine, comme beaucoup de peptides bio-actifs, s’insère dans les membranes des cellules cibles et forme un canal qui provoque la lyse cellulaire. Dans le cadre de cet exposé, nous présenterons, dans un premier temps, les différentes approches utilisées pour obtenir de grandes quantités de pédiocine purifiée. L’optimisation de la purification par une approche biochimique a permis d’obtenir un rendement supérieur de 20 % à ceux donnés dans la littérature. Parallèlement, nous présenterons les résultats de production et purification de la pédiocine à l’aide d’outils mis au point par la biologie moléculaire. Dans un deuxième temps, nous montrerons les premiers résultats obtenus sur la détermination de la structure secondaire de la pédiocine par spectroscopie infrarouge à transformée de Fourier, outil de choix pour l’étude structurale de peptide/protéine en solution ou lié aux membranes.

Contexte

Section :
Biochimie, biologies cellulaire et moléculaire
news icon Domaine de la communication :
Biochimie, biologies cellulaire et moléculaire
host icon Hôte : Université de Montréal

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Thème du communication :

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