Colloque

Recherche systématique de motifs chez les acides ribonucléiques

Emmanuelle Permal-Marande

Membre a labase

Emmanuelle Permal-Marande

Résumé du colloque

Depuis la découverte des ribozymes, il a été montré que les molécules d'Acide RiboNucléiques (ARN) n'étaient pas seulement des supports d'information génétique mais aussi des molécules fonctionnelles au même titre que les protéines. Durant les dernières décennies, la recherche a tenté de dévoiler les multiples facettes de l'ARN, autant au niveau de sa structure que de ses fonctions, par divers moyens dont fait partie la bioinformatique. Les questions auxquelles je m'intéresse sont : 1) Existe-t-il des motifs structuraux typiques récurrents communs ou dépendants d'une classe d'ARN (ARNm, ARNt, ARNr, ARNtm, ARNnc) ? 2) Y a-t-il une relation entre motif structural et fonction ? 3) Si oui, quelle est-elle ? Dans ce but, j'explore les différentes façons de rechercher systématiquement tout motif structural candidat à une ou plusieurs interactions de type ARN/ARN, ARN/ADN ou ARN/Protéine avec des méthodes préexistantes. Pour ce faire, je m'intéresse plus particulièrement à la structure des virus car ces derniers sont des organismes qui ont été très étudiés, ce qui implique l'accessibilité à beaucoup de données, et qui sont d'un grand intérêt d'un point de vue phylogénétique et thérapeutique.