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Réseaux de coévolution des protéines.

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Elisabeth Tillier

Résumé du colloque

La coévolution maintient les interactions entre les traits phénotypiques dans le cadre du processus de la réciprocité de la sélection naturelle. Au niveau des séquences moléculaires, sa détection peut exposer les interactions entre molécules, et donc de générer des connaissances sur les processus biologiques, et les voies et les réseaux d'interactions qui sont importants pour la fonction cellulaire. Des protéines partenaires sujettes à la coévolution peuvent donc êtres prédites à partir de la similitude de leurs arbres phylogénétiques. Nous présentons une nouvelle méthode pour la détermination d'interactions entre protéines qui utilise cette propriété de la coévolution. Nous montrons que la coévolution est clairement détectable pour des interactions connues entre nombreuses familles de protéines, non seulement en raison d'une histoire phylogénétique partagée, mais à cause de leurs taux d'évolution qui sont corrélés. Les protéines qui sont connues pour interagir physiquement coévoluent plus fortement que des protéines qui sont tout simplement dans la même voie biochimique. Le réseau d'évolution des protéines chez l'homme est étroitement lié, ce qui suggère beaucoup plus d'interactions entre protéines, jusqu'ici inconnues. Les plus forts liens sont impliqués dans des processus cellulaires fondamentaux de réplication de l'ADN, la synthèse des protéines et le métabolisme énergétique.

Contexte

host icon Hôte : Université d’Ottawa

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