Colloque

Retracer l'histoire des haplotypes par recombinaisons et conversions géniques

Mathieu Lajoie

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Mathieu Lajoie

Résumé du colloque

Un haplotype est une représentation condensée des caractères génétiques propre à un individu sur un segment chromosomique donné. Cette représentation prend la forme d'une séquence binaire où les 0 indiquent les allèles ancestraux et les 1 les allèles mutés. L'étude des haplotypes est fondamentale pour déterminer les allèles responsables de certaines maladies génétiques rares, et pour comprendre l'histoire des populations. La diversité des haplotypes à l'intérieur d'une espèce résulte de la redistribution des allèles mutés par recombinaisons et conversions géniques. Nous allons présenter une méthode permettant de reconstruire un haplotype donné, par recombinaisons et conversions géniques, à partir de ses haplotypes ancestraux. L'idée est de retrouver des suites minimales de recombinaisons et de conversions géniques permettant de générer le nouvel haplotype en fonction d'un modèle d'évolution donné. Nous appliquerons notre méthode aux haplotypes correspondant au segment dys44 du gène de la dystrophine.