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Séquence et analyse du gène codant la protéine de membrane du coronavirus humain OC43

Samir Mounir
Pierre J. Talbot
SM

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Samir Mounir

Résumé du colloque

Les coronavirus sont responsables d'environ 35% des rhumes; ils sont aussi impliqués dans des maladies entériques et neurologiques. Le gène qui code la protéine de membrane (M) de la souche OC43 du coronavirus humain (HCV-OC43) a été cloné et séquencé. Ce gène a été obtenu par amplification par PCR d'un fragment de 1.5 kb avec des amorces spécifiques aux séquences de deux virus (HCV-OC43 et BCV). Ces deux virus appartiennent au même groupe antigénique. Une analyse détaillée de la séquence obtenue, révèle la présence d'un cadre de lecture ouvert codant une protéine de 230 acides aminés, avec un poids moléculaire apparent de 26,416 Da. La séquence en acides aminés de cette protéine présente 95% d'identité avec celle du coronavirus bovin (BCV). Ce résultat suggère donc que ces deux virus n'ont divergé que récemment. La protéine M de HCV-OC43 possède également trois domaines hydrophobes, qui caractérisent les protéines de membrane des coronavirus déjà séquencées. La conservation relative de cette région suggère que des contraintes structurales sur la protéine M sont rigides.

Contexte

Section :
Biologie moléculaire
news icon Thème du colloque :
Biologie moléculaire
host icon Hôte : Université de Montréal

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Titre du colloque :

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