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Séquence nucléotidique des gènes codant pour les protéines PLP2 et RodA de Pseudomonas aeruginosa PAO1

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Idalia Castro

Résumé du colloque

Pseudomonas aeruginosa est une bactérie pathogène opportuniste, principalement retrouvée chez les patients dont les mécanismes de défense sont affaiblis et ceux atteints de la fibrose kystique. Elle est également une des principales causes d'infections nosocomiales. Les antibiotiques de type ß-lactamine (céphalosporines de la troisième génération) en combinaison avec un aminoglycoside sont recommandés pour le traitement de ces infections. Les ß-lactamines exercent leur action létale sur les protéines liant la pénicilline (PLPs), principalement les PLPs de haut poids moléculaire (H.P.M.) qui catalysent les étapes finales de la synthèse de la paroi bactérienne. Chez P. aeruginosa, sept PLPs ont été identifiées, un profil assez semblable à celui d'E. coli, mais l'affinité des PLPs pour certaines ß-lactamines chez ces deux microorganismes démontre des différences importantes. De plus, l'activité enzymatique et le rôle physiologique des PLPs de P. aeruginosa n'ont pas encore été élucidés. Chez E. coli, il a été démontré que la PLP2 de H.P.M. est responsable du maintien de la forme de la bactérie. Cette protéine agit en conjonction avec la protéine RodA. Les gènes codant pour ces deux protéines font partie d'un opéron retrouvé dans la région mrd à 14.5 min. Cette région contient les gènes codant pour la PLP2, la PLP5 et RodA. Afin de cloner et séquencer les gènes pbpA et rodA codant pour la PLP2 et la protéine RodA de P. aeruginosa, nous avons criblé une banque d'ADN génomique de P. aeruginosa PAO1 construite dans le phage lambda ZAP EXPRESS à l'aide d'une sonde spécifique au gène dacA codant pour la PLP5 de P. aeruginosa PAO1. La cartographie d'un clone contenant un insert de 6.9 kb a permis d'identifier la présence des gènes lipB, dacA, rlpA, rodA ainsi que l'extrémité 3' du gène pbpA. L'analyse de la séquence en acides aminés de la protéine RodA a révélé une similarité de 78.8% et 76.9% avec les séquences de RodA d'E. coli et d'Haemophilus influenzae respectivement. La séquence en acides aminés de la région C-terminale de la PLP2 a révélé la présence des trois motifs conservés retrouvés chez les PLPs (SXXK, SXN et KTG) et une similarité de 65.2% et 63.1% avec les PLP2 d'E. coli et d'H. influenzae. Un nouveau criblage de la banque génomique est en cours afin de cloner et séquencer un fragment d'ADN contenant l'extrémité 5' du gène pbpA. Ces résultats démontrent une forte similarité entre l'arrangement de la région mrd chez E. coli et P. aeruginosa.

Contexte

host icon Hôte : Université de Trois-Rivières

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