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Sites de liaison de la protéine ribosomique bactérienne S7 au RNA ribosomique 16S

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Francis Robert

Résumé du colloque

Les interactions RNA-protéines contrôlent de multiples processus biologiques et le ribosome constitue un modèle intéressant d'études de ces interactions. Le gène codant pour la protéine S7 de la petite sous-unité ribosomique d'E. coli a été isolé par amplification au PCR à partir du DNA génomique de la bactérie E. coli K12A19. Ce gène a été muni d'un "tag à histidine", introduit dans le vecteur d'expression pET21a(+), et exprimé dans les cellules BL21(DE3)pLysS. Des mutations par délétion ou par substitution ont été introduites dans différentes portions de la protéine, principalement les portions N et C terminales et une portion centrale correspondant à un feuillet plissé ß. Ces mutations avaient été choisies de manière à ne pas perturber la conformation globale de la protéine. La capacité de la protéine S7 et de mutants dérivés de la protéine à lier un sous-domaine spécifique du RNA 16S a été évaluée par filtration sur membrane de nitrocellulose. L'ensemble des résultats fournit plusieurs informations quant à l'identité des régions de la protéine directement impliquées dans la liaison au RNA et suggère un modèle d'interaction, où la protéine reconnaît plus d'un site sur le RNA, en accord avec son rôle dans l'assemblage du ribosome.

Contexte

manager icon Responsables :
Rémy Aubin
host icon Hôte : Université d’Ottawa

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