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Techniques de coloration pour améliorer l'analyse des racines par image

Carlos Costa
X. Wang
R. I. Hamilton
D. L. Smith
Chantal Hamel
Didier F. Muamba
Line Nantais
L. M. Dwyer
CC

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Carlos Costa

Résumé du colloque

La collecte des données de systèmes racinaires a traditionnellement été difficile et imprécise. Les racines fines (<0,30 mm de diamètre) totalisent près de 35% de la longueur totale des racines de plusieurs espèces. Leur petite taille et leur transparence rendent difficile la prise d’image pour fins d’analyse. Nous avons tenté de développer une technique d'évaluation relativement rapide de la longueur des racines en utilisant l'analyse d'image. Afin de permettre la collecte d'images claires, plusieurs colorants, y compris le bleu d'aniline, le bleu de toluidine, l'acide fuchsin et le rouge congo, ont été testés. Nous avons utilisé des racines obtenues à partir d'une expérience menée en serre où six espèces de plante (maïs, soya, orge, blé, avoine et fraise) furent cultivées dans des pots contenant un mélange de sol et de sable (2:1). L’essai comportait 3 blocs et deux périodes de récolte: trois semaines après la levée et à la cinquième semaine. Les colorants ont été évalués à plusieurs concentrations (de 0,025 à 0,4%). La technique consistait à immerger des poids égaux de racines fraîches (1 cm de long) dans des colorants pendant trois périodes de temps (0, 10 ou 15 minutes). L’excès de teinture était retiré des racines par rinçage à l'eau courante pendant une minute. Plusieurs variables ont été mesurées en utilisant le système WinRHIZO. Les résultats ont montré des mesures très uniformes, y compris pour les racines fines (diamètre de <0,30 mm). En général, la teinture des échantillons a amélioré l’évaluation de la longueur des racines fines de 10 à 15%. La période de temps allouée à la coloration des racines a influencé significativement la clarté de l’image. Les résultats de ces techniques de coloration seront mis à profit en vue de tester et d'améliorer l’étude des mycorhizes par image.

Contexte

Section :
Colloque sur la symbiose mycorhizienne
news icon Thème du colloque :
Colloque sur la symbiose mycorhizienne
manager icon Responsables :
Horst Vierheilig
host icon Hôte : Université Laval

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Titre du colloque :

Colloque sur la symbiose mycorhizienne
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Thème du colloque :

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