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Théorie générale du traitement de l'énergie de solvatation dans des simulations de dynamique moléculaire

Simon Berneche
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Simon Berneche

Résumé du colloque

Dans plusieurs études de dynamique moléculaire il est souhaitable de pouvoir traiter explicitement qu’une région d’un système, le reste du système étant considéré comme un continuum. Ce continuum, traité à l’aide de l’équation de Poisson-Boltzmann, est défini de façon à rendre compte de l’influence d’un solvant ionique, d’une membrane et/ou d’une partie de la protéine qui ne serait pas incluse dans la région traitée explicitement. Cette approche peut notamment être utilisée pour l’étude de canaux ioniques ou de sites actifs de protéines.

Contexte

Section :
Science moléculaire computationnelle
news icon Thème du colloque :
Science moléculaire computationnelle
host icon Hôte : Université d’Ottawa

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Titre du colloque :

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