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Un modèle tridimensionnel du site de liaison de la protéine REV, présent sur les ARN messagers du VIH

Fabrice Leclerc
Robert Cedergreen
Andrew D. Ellington
FL

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Fabrice Leclerc

Résumé du colloque

La protéine REV gouverne la production de protéines de structure messagères du déroulement de la virulence. En se liant aux ARN messagers du HIV, porteurs de cette séquence spécifique, elle régule l'expression des gènes viraux. Des études de mutagénèse dirigée, en utilisant des acides nucléiques synthétiques, ont montré que le site de liaison REV est hautement conservé parmi 20 molécules d'ARN synthétiques, et que les structures tertiaires de ces molécules sont suffisantes. Un modèle de structure tertiaire de cette région aidant à comprendre les mécanismes de régulation a été proposé. Des analyses phylogéniques ont permis de démontrer que les bases appariées dans les structures secondaires et tertiaires ont été conservées, ce qui programme MC-SYM, un ensemble de programmes de modélisation moléculaire, a permis de modéliser le site de liaison de REV. Ce modèle a été validé par des études de mutagénèse dirigée, et a permis de proposer un mécanisme d'interaction moléculaire essentiel pour la fonction de REV. Ce modèle a été utilisé pour suggérer des interactions moléculaires possibles avec des inhibiteurs de l'action de REV, et des essais sont en cours pour valider ces hypothèses. La découverte récente de l'action inhibitrice d'un antibiotique sur les transcrits ARX-protéines a permis également de proposer un modèle d'interaction anti-enzymatique. Ces résultats permettent de suggérer une interprétation du mécanisme d'association et de sa spécificité, essentielle pour le développement de nouveaux anti-VIH actifs.

Contexte

Section :
Biochimie, biologie moléculaire
news icon Thème du colloque :
Biochimie, biologie moléculaire
host icon Hôte : Université du Québec à Montréal

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Titre du colloque :

Biochimie, biologie moléculaire
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