Colloque

Utilisation des méthodes statistiques dans le calcul des propriétés physico-chimiques des molécules peptidiques

Catherine Jeandenans

André Michel

Membre a labase

Catherine Jeandenans

Résumé du colloque

Le caractère flexible des molécules peptidiques conduit à l'existence d'un équilibre entre un grand nombre de conformations en solution. Plutôt que d'étudier quelques conformations isolées, nous précisons l'étude globale, par méthodes statistiques, de populations de conformères. Le programme PEPSEA (PEPtide SEArch), développé au laboratoire, génère aléatoirement et minimise des populations conformationnelles de peptides par des méthodes de mécanique classique. La population de conformères est ensuite analysée par méthodes statistiques afin de déterminer les composantes principales et rechercher des groupements (Cluster Analysis). Nous obtenons alors des regroupements de conformères en familles qui permettent de décrire le comportement de la molécule. Le calcul de l'énergie de partition effectué sur les populations de conformères atteste la possibilité de recalerur d'expliquer ces résultats expérimentaux en RMN, dichroïsme circulaire et fluorescence.

Contexte

Section :

Chimie physique et des surfaces

Thème du colloque :

Chimie physique et des surfaces

Hôte : Université de Montréal

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