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Résumé du colloque
Le virus de l'artérite équine (VAE) induit une infection persistante chez les équidés. Le génome du VAE consiste en une molécule d'ARN positif à simple brin de 12,7 kb contenant 8 cadres de lecture ouvert (ORFs). Les protéines structurales du virion incluent la nucléoprotéine N de 14 kDa et trois protéines au niveau de l'enveloppe identifiées comme étant une protéine non-glycosylée M de 16 kDa, une glycoprotéine mineure GS de 25 kDa, et une glycoprotéine majeure GL de 30 à 42 kDa sur laquelle se trouve un épitope majeur inducteur d'anticorps neutralisants. Au cours de ce travail, nous avons déterminé et comparé les séquences nucléotidiques (obtenues par RT-PCR) de l'ORF 2 codant pour la protéine GS de neuf isolats du VAE, incluant la souche de référence Bucyrus. La présence de sites antigéniques suite à l'analyse des acides aminés fut aussi prédite. Les résultats ont notamment démontré des taux élevés d'homologie (91 à 97%) entre les isolats étudiés tant au niveau des séquences en acides nucléiques qu'au niveau de celles des acides aminés déduits. L'analyse des séquences des acides aminés a de plus révélé la présence possible d'un épitope séquentiel majeur immunodominant (conformation en tour-ß) présent chez tous les isolats, situé aux positions 212-218, 212-217 ou 212-219, et montrant des indices antigéniques (IA) variant de 1,35 à 1,50. La présence d'un ou deux autres sites antigéniques séquentiels, dépendamment de l'isolat étudié, et montrant des IA moins élevés a aussi été prédite. La nature exacte du site antigénique majeur reste à être déterminée.
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