Colloque

Vers l’analyse protéomique quantitative d’échantillons biologiques complexes

Jerome Garin

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Jerome Garin

Résumé de la communication

Il existe une grande variété de stratégies possibles pour réaliser des analyses protéomiques quantitatives. Ce sont à la fois la nature du matériel biologique et le type de question posée qui conduisent à utiliser une stratégie plutôt qu'une autre. On peut globalement distinguer deux types de stratégies parfaitement complémentaires : les études protéomiques à large échelle et/ou sans a priori, et les études quantitatives ciblées sur des protéines d'intérêt. Les études à large échelle sont par essence naïves ; elles peuvent par exemple être mises en œuvre pour analyser la dynamique d'un système biologique dans le cadre d'une étude cinétique : réponse à un ligand de récepteur, à une modification du métabolisme énergétique. Ce type d’approche permet la découverte sans aucun a priori d’acteurs moléculaires impliqués dans les mécanismes biologiques étudiés. Dans un contexte clinique, les mêmes approches naïves peuvent être utilisées pour comparer des échantillons biologiques issus de personnes saines et de patients atteints d'une pathologie ; elles conduiront alors à la découverte de candidats biomarqueurs de la pathologie. Les études quantitatives ciblées, elles, font appel à des méthodes qui permettent l'obtention de données de meilleure qualité sur un nombre limité de protéines grâce à l’utilisation de la spectrométrie de masse de type SRM ("Selected Reaction Monitoring") et de standards de quantification adaptés à la stratégie analytique mise en œuvre. L’objectif de mon expos

Résumé du colloque

Plusieurs conférenciers de marque participeront à ce colloque, et nous coordonnons avec le réseau national Canadien de protéomique l’attribution d’un prix annuel qui pourrait être décerné lors de cet événement.

Contexte

Section :

Protéomique et biologie des systèmes

Thème du colloque :

Protéomique et biologie des systèmes

Hôte : Université de Montréal

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Titre du colloque :

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