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Les molécules d'acide ribonucléique (ARN) sont présentes dans toutes les cellules du vivant, et y remplissent de nombreux rôles essentiels grâce à leur capacité de se replier en diverses structures complexes. Alors que ces structures leur donnent des fonctions diverses certains blocs--- modules structuraux ---sont partagés et utilisés dans différent contexte avec parfois une grande variété de séquences. Plusieurs méthodes permettent de répertorier automatiquement ces modules identiques entre différentes molécules d'ARN. En particulier, de très bons résultats ont été obtenus en abstrayant la structure 3D atomique en un graphe, qui est annoté avec les interactions entre nucléotides et leurs 12 …