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Le potentiel électrostatique moléculaire (PEM) est un observable physique donnant de l'information autant sur la structure électronique des molécules que sur leur réactivité. Une analyse des points critiques du PEM sera présentée, indiquant leur relation avec la structure électronique et la réactivité des différents types de systèmes moléculaires.
Les méthodes traditionnelles de calculs ab initio sont beaucoup trop coûteuses pour l’étude des systèmes organiques de la taille des enzymes ou des protéines. Même les méthodes basées sur la théorie de la fonctionnelle de la densité (TFD) sont encore trop coûteuses. D’un autre côté, seul le site actif de la protéine nous intéresse vraiment. Le reste de la protéine peut donc être traité à un niveau de théorie moins sophistiqué, et le temps de calcul s’en trouve d’autant réduit. C’est ce que nous nous proposons de faire dans le cadre du présent projet. Pour ce faire, des approximations basées …
Les méthodes traditionnelles de calculs ab initio sont beaucoup trop coûteuses pour l’étude des systèmes organiques de la taille des enzymes ou des protéines. Même les méthodes basées sur la théorie de la fonctionnelle de la densité (TFD) sont encore trop coûteuses. D’un autre côté, seul le site actif de la protéine nous intéresse vraiment. Le reste de la protéine peut donc être traité à un niveau de théorie moins sophistiqué, et le temps de calcul s’en trouve d’autant réduit. C’est ce que nous nous proposons de faire dans le cadre du présent projet. Pour ce faire, des approximations basées …
La liaison hydrogène joue un rôle important dans les systèmes biologiques: elle est responsable de la structure tertiaire des protéines, des propriétés spéciales de l’eau, de la catalyse de réactions chimiques dans le métabolisme des êtres vivants. Il est donc important de bien connaître la liaison hydrogène. Pour ce faire, nous utilisons la théorie de la fonctionnelle de la densité (TFD), appliquée à de petits systèmes comportant un pont hydrogène (dimère d’eau, acide glyoxylique, malonaldéhyde, complexe eau-formamide). Une fois la méthode mise au point, nous l’appliquerons à des systèmes plus gros i.e. réels, pour en étudier la structure électronique, la …