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Le bassin hydrographique de la rivière Saint-Joseph se situe sur le delta de Lanaorière formé par le paléo-Saint-Laurent au contact du lac à Lampmis et dont le lac Saint-Pierre est le reliquat. Sur 15 km de parcours, la rivière Saint-Joseph traverse une tourbière puis un secteur agricole. Les affluents sont surtout situés dans un secteur secteur. Tout au long de la rivière, le biotope a changé selon les modifications du biotope. Contrairement à la flore reprenant une coupe de 25 espèces de macrophytes, l'exploitation agricole modifie plus de 150 espèces. Ces espèces sont retrouvées autant dans le secteur de la …