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Dynamique moléculaire du complexe streptavidine-ADN
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La vingtaine d'années qui suivit la découverte de la structure de l'ADN mena à une panoplie de découvertes théoriques et expérimentales dans le domaine de la biologie moléculaire. Un facteur qui limite grandement la révolution biotechnologique est la vitesse à laquelle on peut décoder l'information contenue dans l'ADN. Nombres d'efforts sont actuellement déployés pour augmenter le nombre de nucléotides qui peuvent être lues par expérience d'électrophorèse. Ici, nous examinons comment le fait d'ajouter une grosse protéine neutre (la streptavidine MW=52000) à un des bouts des molécules d'ADN va modifier leur dynamique sous électrophorèse. Nous avons étudié la dynamique de cette …

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Dynamique moléculaire du complexe streptavidine-ADN
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La vingtaine d'années qui suivit la découverte de la structure de l'ADN mena à une panoplie de découvertes théoriques et expérimentales dans le domaine de la biologie moléculaire. Un facteur qui limite grandement la révolution biotechnologique est la vitesse à laquelle on peut décoder l'information contenue dans l'ADN. Nombres d'efforts sont actuellement déployés pour augmenter le nombre de nucléotides qui peuvent être lues par expérience d'électrophorèse. Ici, nous examinons comment le fait d'ajouter une grosse protéine neutre (la streptavidine MW=52000) à un des bouts des molécules d'ADN va modifier leur dynamique sous électrophorèse. Nous avons étudié la dynamique de cette …

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Dynamique moléculaire du complexe streptavidine-ADN
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La vingtaine d'années qui suivit la découverte de la structure de l'ADN mena à une panoplie de découvertes théoriques et expérimentales dans le domaine de la biologie moléculaire. Un facteur qui limite grandement la révolution biotechnologique est la vitesse à laquelle on peut décoder l'information contenue dans l'ADN. Nombres d'efforts sont actuellement déployés pour augmenter le nombre de nucléotides qui peuvent être lues par expérience d'électrophorèse. Ici, nous examinons comment le fait d'ajouter une grosse protéine neutre (la streptavidine MW=52000) à un des bouts des molécules d'ADN va modifier leur dynamique sous électrophorèse. Nous avons étudié la dynamique de cette …

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Dynamique moléculaire du complexe streptavidine-ADN
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La vingtaine d'années qui suivit la découverte de la structure de l'ADN mena à une panoplie de découvertes théoriques et expérimentales dans le domaine de la biologie moléculaire. Un facteur qui limite grandement la révolution biotechnologique est la vitesse à laquelle on peut décoder l'information contenue dans l'ADN. Nombres d'efforts sont actuellement déployés pour augmenter le nombre de nucléotides qui peuvent être lues par expérience d'électrophorèse. Ici, nous examinons comment le fait d'ajouter une grosse protéine neutre (la streptavidine MW=52000) à un des bouts des molécules d'ADN va modifier leur dynamique sous électrophorèse. Nous avons étudié la dynamique de cette …

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Un modèle simple d'électrophorèse par piégeage menant à une dynamique transitoire compliquée
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La mobilité électrophorétique de l'ADN dans un gel est indépendante de la taille moléculaire quand les segments d'ADN sont plus grands qu'une taille critique. Dans le but de résoudre cette difficulté, on attache à un bout du segment d'ADN un gros objet neutre (la streptavidine). Conséquemment, la migration électrophorétique du complexe streptavidine-ADN est dominée par un phénomène de dépiégeage. Un modèle simple d'électrophorèse par piégeage, basé sur le modèle de reptation biaisé, mène à une dynamique transitoire compliquée. Cette dynamique peut être décrite comme une marche de dérive dans un réseau périodique de pièges ayant une large distribution de temps …

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