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Interactions Lipide-Protéine: Etude de Dynamique Moléculaire de la Gramicidine A dans une Bicouche de DMPC
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Des simulations de dynamique moléculaire de la gramicidine A (GA) dans une bicouche de phospholipides DMPC sont décrites. Un modèle atomique détaillé est utilisé afin de représenter les interactions microscopiques. Les simulations sont faites dans le but d'explorer les propriétés de l'enchaînement GA:DMPC faisant l'objet de nombreux travaux de recherche dans les laboratoires de B. Cornell, T. Cross, et J. Davis par des méthodes de résonance magnétique nucléaire de l'état solide. Les déplacements chimiques, les écarts quadripolaires ainsi que les couplages dipolaires sont calculés à partir de la dynamique et comparés aux valeurs expérimentales. Le profil de densité moyen est …

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