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Notre laboratoire a démontré qu'un des rôles majeurs des topoisomérases lors de la transcription chez E. coli est de réguler la formation de R-loops; un hybride ADN-ARN qui peut se former entre l'ARN naisant et le brin matrice de l'ADN. La RNase H est aussi impliquée dans le contrôle des R-loops; elle permet leur élimination en dégradant la portion ARN de l'hybride. Nous avons déjà mis en évidence la formation de R-loops dans un fragment de la région ARNr 16S de l'opéron rrnB de E. coli ainsi que dans le gène tet codant pour la résistance à la tétracycline. Ces …
Chez E. coli, le rôle principal de la topoisomérase I est attribué à la relaxation du surenroulement négatif global introduit par la gyrase. Or, selon le "twin domain model", le déplacement de l'ARN polymérase durant la transcription génère du surenroulement positif et négatif respectivement en avant et en arrière du complexe transcriptionnel, d'où le rôle important des topoisomérases durant l'élongation de la transcription. En se basant sur ce modèle, nos travaux suggèrent que le rôle essentiel de la topoisomérase I serait plutôt de relaxer le surenroulement négatif généré durant l'élongation de la transcription. Ceci a pour but de prévenir la …
La fonction principale de la topoisomérase I chez E. coli est de prévenir la formation d’hybrides ADN-ARN (ou R-loops) pendant la transcription. Des études ont démontré que des R-loops sont formés lors de la transcription de l’opéron rrnB chez les mutants topA. L’observation la plus intéressante en ce qui a trait à la transcription des opérons ribosomaux est sans doute le fait que le taux de duplications entre les différents opérons rrn augmente par un facteur de 20 à 50 fois chez le mutant topA à 37 degrés Celcius par rapport à la souche isogénique. Il est connu que de …
Chez E. coli, lors de l'élongation transcriptionnelle, le déplacement de l'ARN polymérase le long de l'ADN génère du surenroulement négatif en amont et surenroulement positif en aval ("twin-domain model"), lieux d'action respectifs de la topoisomérase I (relaxation de l'ADN) et de la gyrase (introduction de supertours négatifs). Lors de la transcription, l'augmentation du surenroulement négatif dû à l'inactivation de la topoisomérase I entraîne la séparation des brins d'ADN et permet la production d'hybrides ARN-ADN ("R-loops"). Chez les mutants topA (topo I), l'inhibition de croissance peut être corrigée par la surproduction de la RNase H, une enzyme dégradant le brin d'ARN …
Le trypanosome du genre Leishmania est un protozoaire intra-cellulaire qui infecte les macrophages des mammifères dont l'humain. Plusieurs pathologies peuvent se développer selon l'espèce en cause : la leishmaniose cutanée, la leishmaniose mucocutanée ou la leishmaniose viscérale mortelle. L'incidence des leishmanioses est actuellement à la hausse, notamment à cause de l'absence de vaccins efficaces et du développement de résistances du parasite face à la chimiothérapie. Notre but est de développer une nouvelle stratégie de chimiothérapie basée sur l'utilisation de poisons anti-topoisomérases. Ces composés agissent en interférant avec la réaction de cassure-ligation des topoisomérases et en stabilisant l'intermédiaire ADN clivé-topoisomérase. Ils …
Nous avons récemment décrit des mutants topA de Escherichia coli présentant des mutations compensatoires conditionnelles de leur phénotypes. Nous avons découvert que le problème de croissance de ces mutants à température non-permissive est partiellement corrigé par la surproduction de la RNase H, spécialement lorsque les cellules sont soumises à un "shift-up" nutritionnel. Dans ces conditions, il est très bien connu que les opérons rrn, qui codent pour les ARNr, sont fortement exprimés. Également, nous avons récemment présenté des évidences biochimiques et génétiques que la formation de R-loops peut se produire durant la transcription des opérons rrn, dans un mutant topA. …
Le sujet de la communication portera sur l’élucidation des mécanismes d’activation de la réplication stable et constitutive (cSDR) chez E. coli. Ce type de réplication chez E. coli peut survenir lorsque le gène responsable de la synthèse de la RNase H (rnhA), qui dégrade l’ARN présent dans les hybrides ARN-ADN, est inactivé. Il est présumé qu’en absence de la RNase H, certains hybrides ARN-ADN persistent formant ainsi une structure R-loop qui peut servir de site d’initiation pour la réplication. Ce type de réplication de l’ADN peut se dérouler en absence de synthèse protéique, peut s’initier à des origines de réplication …
Le parasite du genre Leishmania, membre de la famille des trypanosomes, est un potozoaire intracellulaire qui infecte les macrophages des mammifères dont l'humain. Suivant l'infection par Leishmania, plusieurs pathologies peuvent se développer selon l'espèce en cause. Parmi celles-ci, on compte la leishmaniose cutanée, mucocutanée et la leishmaniose viscérale mortelle. L'incidence des leishmanioses est à la hausse, notamment à cause de l'absence de vaccins efficaces et du développement de la résistance du parasite à la chimiothérapie. La mise au point de traitements alternatifs est donc nécessaire pour combattre ce type d'infection. Nous voulons développer une nouvelle stratégie de chimiothérapie basée sur …