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Compléter les gènes manquants des échafaudages à l'aide de l'évidence comparative
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L'étendue phylogénétique du séquençage de génomes est de plus en plus importante. Cependant, celà ne s'accompagne pas nécessairement de l'amélioration de la qualité des séquences pour l'ensemble des génomes. En effet, une proportion croissante des génomes sont publiés sous forme d'"échafaudage", ou "squelette de contigs". Un grand nombre de gènes sont absents de l'échafaudage, même si leur présence dans le génome est établie dans les ensembles d'EST. Nous proposons une méthode qui consiste à remplir de façon optimale les échafauds par les gènes manquants, tout en intégrant ces échafauds ainsi augmentés directement dans les algorithmes de réarrangement génomiques comme s'ils …

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Processus de reduction de génome dans un tétraploïde
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Nous avançons deux hypothèses nulles au sujet des gènes dupliqués perdus conséquent à la re-diploïdisation d'un génome tetraploïde. L'une est que la paire de gènes destinée à perdre un membre est choisie au hasard, indépendamment du statut des gènes avoisinants, c'est-à-dire si eux-mêmes sont des membres de paires intactes ou réduites. La deuxième hypothèse est que si une paire de gènes dupliqués perd un membre, ce membre est choisi au hasard, c.-à-d. chacun avec probabilité 1/2, indépendamment du statut des gènes avoisinants. À partir des données génomiques sur des levures, plantes et protistes qui ont subi la tétraploïdisation ancestrale, nous …

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L'absence d'inflexion des emprunts dans le français cadjin
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Un indice qui permet de distinguer les emprunts des alternances de code est l'application des processus d'inflection de la langue réceptrice aux emprunts de la langue donneuse. Ces processus s'appliquent autant aux emprunts spontanés qu'aux emprunts établis. Par contraste, à l'intérieur des alternances, les inflections et les racines proviennent tous de la même langue. Il y a des communautés bilingues où la difficulté d'agencer des inflections verbales d'une langue aux racines de l'autre empêche l'emprunt spontané des verbes sauf en tant que racine complément d'un verbe porteur comme faire. Par contre, dans le français cadjin de la Louisiane, les racines …

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Le discours mixte arabe/français: des emprunts ou des alternances de langues?
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La théorie des emprunts lexicaux fait des prédictions quant aux classes de mots de L2 les plus susceptibles à être empruntées et quant à la nature de leur intégration morphologique et syntaxique dans des phrases en L1. Pour ce qui est des emprunts, soit établis et acceptés, soit à usage momentanée, ce sont surtout des mots de contenu: des substantifs, des verbes, des adjectifs, des adverbes, etc., et non pas des déterminants, des prépositions. Ces emprunts ne montrent pas en général jamais la morphologie productive de L2, mais plutôt celle de L1, et leur position syntaxique est celle de L1. …

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Réduction d’un modèle logistique-linéaire de données multinômiales
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Un modèle logistique-linéaire est souvent utilisé pour expliquer les effets de plusieurs facteurs sur le paramètre d’une expérience binômiale. Différentes façons de généraliser ce modèle à des données multinômiales (avec n×2 observations possibles) existent. Nous suggérons la généralisation qui semble la plus naturelle et nous montrons, afin de simplifier les calculs, comment l’analyse de maxima de vraisemblance peut être effectuée par moyen d’une réduction à n – 1 analyse de problèmes binômiales.

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La structure secondaire de l'ARN 5S
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Parallèlement aux études de l'évolution de la structure primaire de la molécule ARN 5S, nous avons entrepris une investigation du développement de la structure secondaire. Ce projet rencontre des difficultés dues à l'insuffisance des résultats expérimentaux sur les paires bases spécifiques qui déterminent cette structure. Notre solution à ce problème est basée sur les valeurs de l'énergie libre connues pour des configurations des oligonucleotides. A partir de l'hypothèse de travail que l'énergie libre d'une structure est approximativement la somme des énergies de toutes les sous-structures qui la constituent, nous nous servons de deux types d'algorithmes, implantés sur ordinateur, pour maximiser …

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Un outil empirique pour étudier la pragmatique universelle
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Habermas prétend que dans tout acte de parole où le but est une compréhension consensuelle, il y a nécessairement quatre types de conditions de validité à satisfaire simultanément. Les critères de vérité, de véracité, de compréhensibilité et de conformité relèvent des domaines de l'objectivité, de la subjectivité, de l'intersubjectivité et de la normativité, respectivement. L'étude des autocorrections dans la conversation courante nous fournissent des indices de la non-satisfaction de certains critères de validité spécifiques, et ainsi nous permettent de critiquer et raffiner les catégories de Habermas.

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Arbres phylogéniques minimals
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Étant donné O, un ensemble de séquences finies, un arbre phylogénique minimal est un arbre dont l'ensemble des sommets s'identifie à O ∪ H où H est un ensemble (possiblement vide) de séquences et tel que la somme des longueurs des branches est minimale. La longueur de la branche a est le nombre minimal de mutations nécessaires pour transformer les séquences a et b d'une manière qui les rend identiques. Une mutation peut être ou (1) un changement (remplacement) de la valeur d'un terme dans l'une des séquences afin de la rendre égale à la valeur d'un terme dans l'autre …

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Nouveaux résultats en mathématiques électorales
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La disproportion entre le vote populaire d'un parti et sa représentation législative est bien connue au Québec. On a montré qu'un tel effet n'est dû ni à la répartition au hasard des partisans dans les comtés, ni aux inégalités dans la carte électorale, mais à un équilibre entre les forces de régionalisation et coalition. Nous avons récemment résolu certains jeux mathématiques qui portent sur un tel système et nous pouvons comparer les stratégies optimales et paiements avec les lois empiriques connues.

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