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Communication
Les espèces eucaryotes ont toutes trois ARN polymérases qui transcrivent différents types de gènes. L’ARN polymérase I transcrit les gènes codant pour les ARN ribosomaux, l’ARN polymérase II transcrit les gènes codant pour les ARN messagers et l’ARN polymérase III transcrit les gènes codant pour les ARN de transfert et les gènes ribosomaux 5S. Nous avons utilisé différents logiciels pour étudier l’évolution de ces gènes. Ces trois enzymes ont des régions fonctionnelles mobiles dont les longueurs sont significativement différentes et les acides aminés qui les différencient sont regroupés près du centre catalytique de ces enzymes. L’analyse des séquences de 25 …
Colloque
Chez la majorité des espèces eucaryotes, les cellules germinales contiennent la moitié de l’ADN contenu dans les cellules somatiques. Par contre, les cellules germinales de certaines espèces contiennent plusieurs fois la quantité d’ADN contenu dans les cellules somatiques et une quantité importante de cet ADN est éliminée durant la différenciation des cellules embryonnaires en cellules somatiques. Ce processus est appelé la diminution de chromatine et a été décrit chez plusieurs espèces de protozoaires ciliés, de copépodes, d’insectes, de nématodes et de myxines. Mes études visent à : 1) caractériser l’ADN qui est éliminé durant la diminution de la chromatine chez …
Colloque
Nous avons utilisé la méthode GENECONV pour caractériser les conversions géniques qui se sont produites entre les gènes du génome humain qui codent pour des protéines et qui font parti des 1 434 familles multigéniques ayant plus de deux gènes. Les conversions géniques se produisent à une fréquence de 0.88 % et ont une longueur moyenne de 371 paires de bases. La taille et la fréquence des conversions sont corrélées avec la similarité des séquences impliquées dans ces conversions. La fréquence des conversions et le taux de recombinaison sont aussi corrélés. Les conversions intrachromosomiques sont presque 5 fois plus fréquentes …
Colloque
La science peut être définie comme étant une activité humaine qui cherche à mieux comprendre le monde qui nous entoure à l’aide de la méthode scientifique. On peut donc considérer que les sciences sont une activité normale de toutes les cultures. Alors pourquoi est-il si difficile d’étudier et de pratiquer les sciences en français en Amérique du Nord? De mon point de vue, trois facteurs semblent jouer un rôle particulièrement important : l’hégémonie de la culture anglo-saxonne, la prédominance de l’anglais comme langue de publication en science et la culture entrepreneuriale des scientifiques. Dans notre présentation, nous discuterons de la …
Communication
Nous avons caractérisé les conversion géniques ectopiques dans les génomes des souches K-12 MG1655, O157:H7 Sakai, O157:H7 EDL933, and CFT073 de E. coli. Le génome de la souche K-12 a des familles multigéniques plus petites et qui contiennent moins de gènes que ceux des souches pathogéniques. De plus, les conversions géniques sont moins fréquentes, et requièrent des séquences flanquantes plus similaires, dans le génome de la souche K-12 que ceux des souches pathogéniques. Il y a donc plus de recombinaison, et les conversions géniques nécessitent moins de similarité, chez les souches pathogéniques que chez la souche K-12. Ces caractéristiques sont …
Colloque
Plusieurs exemples de conversion géniques entre les membres de familles multigéniques sont connus. Par contre, aucune étude n'avait, jusqu'à maintenant, présentée une analyse détaillée de tous les évènements de conversion génique dans le génome d'une espèce particulière. La banque de donnée de la séquence complète du génome de Saccharomyces cerevisiae (http://genome-www.stanford.edu/Saccharomyces/) fut utilisée pour extraire les séquences des 52 familles multigéniques de la levure contenant trois séquences ou plus, dont les séquences avaient une valeur P-BLAST de 10^(-20) ou moins, et dont les séquences protéiques étaient alignées à plus de 80 %. Ces séquences furent analysées à l'aide d'un programme …
Colloque
Quoique plusieurs exemples de conversion génique entre les membres des familles multigéniques du génome humain aient été publiés, la fréquence de ces événements n'a jamais été étudiée. J'ai entrepris une telle étude et j'en présente les résultats préliminaires. Mon approche consiste en cinq étapes. J'utilise la banque de donnée Hovergen pour extraire les alignements des séquences protéiques de toutes les familles multigénique humaine contenant plus de trois gènes. J'utilise ensuite le logiciel Query, distribué avec la banque de donnée Hovergen, pour extraire les séquences d'ADN codant pour ces protéines. J'aligne ensuite ces séquences d'ADN en me basant sur l'alignement des …
Colloque
La vingtaine d'années qui suivit la découverte de la structure de l'ADN mena à une panoplie de découvertes théoriques et expérimentales dans le domaine de la biologie moléculaire. Un facteur qui limite grandement la révolution biotechnologique est la vitesse à laquelle on peut décoder l'information contenue dans l'ADN. Nombres d'efforts sont actuellement déployés pour augmenter le nombre de nucléotides qui peuvent être lues par expérience d'électrophorèse. Ici, nous examinons comment le fait d'ajouter une grosse protéine neutre (la streptavidine MW=52000) à un des bouts des molécules d'ADN va modifier leur dynamique sous électrophorèse. Nous avons étudié la dynamique de cette …
