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Colloque
Deux algorithmes ont été développés pour estimer la conductivité de canaux de transport d'ions, en utilisant seulement les coordonnées de noyaux atomiques disponibles dans les bases de données. Le premier algorithme calcule la trajectoire d'un objet-point qui traverse le canal ionique, celui-ci représenté avec des sphères dures. Le deuxième algorithme détermine l'aire de la section tranversale au canal, perpendiculaire à la trajectoire de passage. La méthode présentée améliore certaines limitations des modèles antérieurs puisqu'elle considère l'environnement tridimensionnel complet de la protéine qui forme le canal. Dans la communication présente, toutes les régions accessibles au solvant à l'intérieur du canal sont …
