Veuillez choisir le dossier dans lequel vous souhaitez ajouter ce contenu :
Filtrer les résultats
Colloque
Les patrons de changement de forme globale d'une macromolécule flexible peuvent être étudiés avec avantage dans un espace de deux propriétés: (a) l'anisométrie, qui décrit la globularité de la conformation, et (b) la complexité des enchevêtrements, qui décrit l'organisation spatiale relative des sections d'une chaîne. Dans cette communication, on applique ces idées pour analyser la dynamique de relaxation d'une protéine dépliée dans le vide, la lysozyme. On observe que les transitions de forme de la lysozyme perturbée correspondent à un pliement organisé, et non pas à une transition de collapse au hasard. Nos résultats montrent qu'une protéine dans le vide …
Colloque
Deux algorithmes ont été développés pour estimer la conductivité de canaux de transport d'ions, en utilisant seulement les coordonnées de noyaux atomiques disponibles dans les bases de données. Le premier algorithme calcule la trajectoire d'un objet-point qui traverse le canal ionique, celui-ci représenté avec des sphères dures. Le deuxième algorithme détermine l'aire de la section tranversale au canal, perpendiculaire à la trajectoire de passage. La méthode présentée améliore certaines limitations des modèles antérieurs puisqu'elle considère l'environnement tridimensionnel complet de la protéine qui forme le canal. Dans la communication présente, toutes les régions accessibles au solvant à l'intérieur du canal sont …
