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Les plantes ont développé plusieurs mécanismes de défense biochimiques en réponse à l'attaque de pathogènes et de stress environnementaux. À la suite de l'attaque de pathogènes, les plantes synthétisent des produits phénolés et plusieurs protéines de défense. Parmi ces protéines on retrouve les 'pathogenesis-related proteins' qui incluent les enzymes chitinases et glucanases dont la fonction est de dégrader les parois cellulaires des champignons. Les endochitinases des plantes supérieures catalysent l'hydrolyse de la chitine, un homopolymère de β-1, 4-N-acétyl-D-glucosamine que l'on retrouve au niveau des hyphes des champignons et chez les insectes. En réponse à l'attaque de pathogènes, les plantes synthétisent …
Chez le tabac, un facteur d'activation de la transcription TAF-1, code pour une protéine qui se lie à une séquence conservée, appelée boîte I (GTCAGTGGCGC). Cette séquence de 10 nucléotides se situe en amont des gènes raflés (A, B, C et D) du riz et sert de site de fixation pour des protéines nucléaires (facteur trans-actif). L'abondance des ARNm de TAF-1 particulièrement dans les racines des plants de tabac semble être due au facteur qui régule des gènes préférentiellement exprimés dans les racines. Le facteur TAF-1 présente une région basique suivie d'un motif bZip à son extrémité carboxy-terminale. Les séquences …