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Limiter la prédiction de structures à celle d'énergie minimum constitue une simplification irréaliste. En compilant une signature d'un certain nombre des meilleures solutions pour une séquence donnée permet de capturer les isomères topologiques de l'espace des structures accessibles à cette séquence. Nous appelons cette signature l'espace-topo de la séquence d'ARN. Nous avons développé une métrique permettant de comparer des espaces-topo et de regrouper des séquences qui se replient et qui fonctionnent de manière similaire. Une application de la métrique est de prédire l'impact de mutations sur la structure et fonction d'un ARN. Par exemple, l'effet de simples points de mutations …