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Il est facile de montrer que le codage des acides aminés employés dans la biosynthèse des protéines ne s'effectue pas au hasard. Les différents codons d'une signification sont regroupés par voisinage mutationnel de manière à optimiser la survenue de mutations simples synonymes. En d'autres termes, le code est construit pour éviter au mieux la survenue des erreurs par mutations. Considérer ainsi la synthèse des protéines permet de comprendre les raisons de la distribution des codons aux vingt acides aminés. Le code génétique apparaît alors être le meilleur automate que pouvaient produire les mutations dans le milieu prébiotique.