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L’ARN est une molécule versatile avec des applications importantes en médecine, tel que démontré par les vaccins à ARN messager qui ont sauvé des millions de vie. Au-delà de cette application de l’ARN en médecine, nous en explorons plusieurs autres. L’ARN est notamment une cible idéale pour le diagnostic et la détection de pathogènes car, contrairement à l’ADN, même les infections de virus à ARN, telle que la COVID19, peuvent être diagnostiquées en détectant l’ARN avec des techniques de biologie moléculaire adaptées. D’autres applications exploitent des propriétés particulières de l’ARN, c’est-à-dire sa capacité à adopter des structures tridimensionnelles complexes qui, …
Methylobacterium extorquens est une bactérie en mesure de métaboliser le méthanol, une matière première bon marché qui peut être dérivé de déchets. Cette bactérie est donc un organisme modèle pour l’étude du métabolisme des composés à un carbone. Malgré les intérêts grandissants d’utiliser cette bactérie comme un outil biotechnologie pour la production basé sur le méthanol, les ARN noncodants de ce méthanotrophe sont peu connus. Les petits ARN (sARN) jouent un rôle important dans la régulation des gènes, spécialement chez les protéobactéries comme Escherichia coli, ce qui leur permettent de répondre rapidement à des changements environnementaux. Étant donné que M. …
L’importance des ARN noncodants (ARNnc) dans la régulation des gènes nous a motivé à développer des outils bioinformatiques afin de poursuivre la découverte de novo d’ARNnc. Trouver de nouveaux ARNnc est problématique car cela requiert de trouver des structures conservées à travers les immenses banques de séquences publiques. Premièrement, il est difficile de trouver et d’extraire de nombreuses séquences intergéniques pour des gènes ayant une activité particulière à partir de bases de données génomiques. Deuxièmement, le temps de calcul pour la prédiction de structure secondaire d’ARNnc augmente d’une façon exponentielle à l’échelle génomique. Récemment, plusieurs logiciels de prédiction de structure …