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Colloque
Les méthodes d’amarrage (docking) ont joué un rôle important dans la découverte de nouveaux médicaments. Au cours des 20 dernières années, nous avons développé un tel logiciel qui a été modifié pour répondre à des besoins spécifiques en chimie médicinale. Initialement, nos applications de programmes d'amarrage aux antagonistes d'intégrines, aux inhibiteurs de BACE-1 et aux aminosides se liant à l'ARN bactérien ont révélé les limites des logiciels disponibles. Pour répondre à ce défi, nous avons développé Fitted, mettant en œuvre des algorithmes pour la flexibilité des protéines, les molécules d'eau déplaçables et l'amarrage orienté par pharmacophore. D'autres projets de chimie …
Communication
La découverte de nouvelles molécules thérapeutiques est une tâche longue et laborieuse. Afin d’accélérer ce processus, des méthodes informatiques dites in silico ont été développées. Malheureusement, ces outils sont souvent sujets à un compromis entre efficacité et temps de calcul. Notre recherche se concentre alors sur le développement d’un modèle à la fois efficace et rapide pour obtenir l’énergie potentielle et la géométrie optimisée de petites molécules d’intérêt. En effet, ces données sont notamment utiles pour améliorer des programmes de prédiction de chimie médicinale comme le criblage virtuel ou l’amarrage moléculaire.Pour cela, nous avons développé notre propre modèle de mécanique …
Colloque
La découverte de médicaments est un processus long et couteux. Afin d'en accroitre l'efficacité, de nombreuses méthodes informatiques ont été decrites. Dans ce contexte, notre groupe de recherche a développé de nombreux logiciels rassemblés dans la plateforme Forecaster. Cependant ces méthodes sont essentiellement développées pour les médicaments ciblant des protéines. Au cours de cette présentation, nous décrirons nos efforts pour développer des méthodes pour la découverte de molécules ciblant les ARNs.
Communication
La maladie de Parkinson (MP) est une maladie débilitante dont les symptômes s'aggravent progressivement avec le temps. Ces symptômes, tels que des tremblements, un ralentissement des mouvements et la rigidification des muscles, affecteront 1 Canadien sur 500. La MP se caractérise par l'apparition d'agrégats de protéines appelés α-synucléine (α-Syn). Il a été démontré que l'inhibition d’une sérine protéase appelée prolyl oligopeptidase (POP) est associée à une diminution de ces agrégats. Par ailleurs, une activité anormale de cette protéase est observée chez les patients à différents stades de la maladie, faisant de POP une cible intéressante pour le développement de thérapies …
Communication
Le domaine de la catalyse asymétrique a révolutionné la synthèse organique au cours des cinquante dernières années, non seulement en rendant de nouvelles réactions possibles ou plus rapides, mais aussi en favorisant la synthèse d’un seul stéréoisomère comme produit principal. Cependant, le développement de nouveaux catalyseurs chiraux reste un véritable défi qui se traduit souvent par un processus long et laborieux, nécessitant la synthèse et l'évaluation de plusieurs ligands et catalyseurs de manière itérative.Au cours des dernières décennies, le criblage virtuel a été largement adopté comme outil de conception moléculaire en chimie médicinale pour accélérer la découverte de médicaments. En …
Communication
Les coronavirus constituent une large famille de virus associés à des maladies graves telles que le syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS), le syndrome respiratoire du Moyen-Orient (SRMO) et la pandémie de COVID-19. À lui seul, le COVID-19 a entraîné plus de 600 millions de cas et 6 millions de décès, soulignant le besoin urgent de médicaments puissants contre ces virus mortels. Une protéase virale appelée 3-chymotrypsin-like protéase (3CLpro) a été identifiée comme une cible prometteuse pour le développement de thérapies contre les coronavirus en raison de son rôle essentiel dans la réplication virale. La 3CLpro étant une protéase à cystéine, …
Colloque
Le développement de médicaments demeure un processus long et laborieux et surtout très couteux. L'emploi de méthodes de simulation informatique permet d'en réduire les couts et d'en accroitre l'efficacité. Le développement d'une plateforme informatique pour la conception de médicaments sera présentée ainsi que son application au développement de molécules a visée thérapeutique. Plus particulièrement, l'application de cette plateforme a la conception d'inhibiteurs de la prolyl oligopeptidase impliquée dans la maladie d'Alzheimer sera présentée.
